La Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud tiene como Misión formar integralmente médicos, tecnólogos en atención prehospitalaria y especialistas médicos, desde una fundamentación humanística, social, científica, cultural, política y ética; altamente competitivos en el ámbito nacional e internacional, que mantengan y promocionen la salud, con especial atención al estudio y solución de problemas propios del sector defensa y de la comunidad en general y posicionarse en el entorno nacional como una de las mejores en la formación del talento humano en salud.